Prof. Dr. Winfried Kurth
Lehrstuhl für Praktische Informatik / Grafische Systeme
http://www-gs.informatik.tu-cottbus.de/~wwwgs
Praktikum "Datenanalyse und Visualisierung
in der Bioinformatik"
Einführung
in die Bioinformatik und in L-Systeme
(Folien
des Einführungsvortrags vom 3. 4. 2006, ppt-Format)
Vorstellung
der Themen (10. 4. 2006)
Spezielles
Material:
Thema
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1 |
Einführung in L-Systeme: Prusinkiewicz & Lindenmayer,
The Algorithmic Beauty of Plants Mündermann,
L., et al.: Quantitative modeling of Arabidopsis development. Plant Physiol. 139 (2005),
960-968. |
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4 |
Marcus Ackermann: Biomorphe. (Seminararbeit, TH Darmstadt 1998). Ole
Kniemeyer, Gerhard H. Buck-Sorlin, Winfried Kurth: Representation of genotype and phenotype in a coherent framework
based on extended L-Systems. (Proceedings ECAL 2003,
Dortmund; Springer, Berlin 2003, 625-634). Richard Dawkins: The evolution of
evolvability. (C.
Langton (ed.): Artificial Life. Addison-Wesley 1988, 201-220), erhältlich bei
den Betreuern. Bamzooki-Projekt
(Children's BBC). |
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6 |
Überarbeitete
Aufgabenstellung / Leitfaden (19. 4. 2006) zur
Einführung in die Thematik: Diplomarbeit Thomas Rutkowski (erhältlich auf
Anfrage) Einstieg
in die eigentliche Aufgabenstellung: Diplomarbeit Michael Soffner (erhältlich
auf Anfrage) ergänzend
(aber umfangreich): Dissertation Matthias Lange (erhältlich auf Anfrage) Homepage der Microarray Gene Expression Data Society - MGED Society (v.a. den Punkt "Ontologies (OWG)" beachten) Materialien
zur FLAREX-Datenbank (1.)
(2.) (3.) Eine Beispieldatei
mit Genexpressionsdaten für Gerstensamen (verschiedene Gewebe: Embryo,
Endosperm, Perikarp). So oder so ähnlich könnte eine Eingabedatei aussehen,
für die eine Ontologie erstellt werden muss. |
E-mail-Adressen
der Betreuer:
Thema
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1 |
Gerhard
Buck-Sorlin Winfried Kurth |
gerhard.buck-sorlin(at)ipk-gatersleben.de wk(at)informatik.tu-cottbus.de |
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4 |
Ole
Kniemeyer Gerhard
Buck-Sorlin |
okn(at)informatik.tu-cottbus.de gerhard.buck-sorlin(at)ipk-gatersleben.de |
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6 |
Gerhard
Buck-Sorlin Matthias
Lange Karl
Spies |
gerhard.buck-sorlin(at)ipk-gatersleben.de lange(at)ipk-gatersleben.de spies(at)ipk-gatersleben.de |
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Letzte Änderungen: 17. 5. 2006